Randers Frejas hovedforening er det samlende organ for Frejas fire sportslige afdelinger.

Hovedafdelingen har som hovedarbejdsopgaver driften af klubhuset og driften af klubhuskontoret.
Frejas fire sportslige afdelinger er økonomisk selvstændige og vælger en selvstændig bestyrelse på afdelingens generalforsamling.

Hovedafdelingens bestyrelse, klubbestyrelsen, består af en valgt formand, en valgt kasserer og et valgt bestyrelsesmedlem og dertil en bestyrelsesrepræsentant for hver af de fire sportslige afdelinger.